Została określona w Regulaminie Biura Bezpieczeństwa Narodowego, który stanowi załącznik do Zarządzenia Nr 2 Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 11 sierpnia 2010 r. w sprawie organizacji oraz zakresu działania Biura Bezpieczeństwa Narodowego, którego treśc została zmieniona na mocy zarządzenia Nr 1 Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 30 stycznia 2012 r.

• Biurem kieruje Szef w randze sekretarza stanu, wyznaczony przez Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej.
• Szef kieruje Biurem przy pomocy Zastępców Szefa, powoływanych i odwoływanych przez Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej na wniosek Szefa Biura.
• Szef kieruje Biurem także przy pomocy Dyrektorów – kierowników komórek organizacyjnych Biura.

W skład Biura wchodzą następujące komórki organizacyjne:

1. Gabinet Szefa Biura;
2. Departament Analiz Strategicznych;
3. Departament Zwierzchnictwa nad Siłami Zbrojnymi;
4. Departament Prawa i Bezpieczeństwa Pozamilitarnego;
5. Pion Pełnomocnika do spraw Ochrony Informacji Niejawnych.